Lotus Notesを使うメリットだが、Webアプリが比較的簡単に作成できることがあげられると思う。
同一アプリを、社内はリッチクライアントでさくさく動作させ、社外はWebアプリで動作させることができるのはNotesだけかも。
SQL ServerともODBC経由で、データを参照・変更ができてしまう。

しかも、Express版だと１ライセンス約２万円。（ＣＤは１．６万円）

メールは使用せず、匿名ユーザ利用のアプリ専用にすれば1ライセンス分だけでいいみたい。

しかも、IBMさんの電話・メールでのサポートが１年間利用できてしまう。

デメリットは？
知ってる人が少ない。Web上の情報が少ない。市販本が１冊のみ（アプリ版）。研修は受講料が高い。

でも、メリットのほうが大きいかも。

2010/09/28　追加

訂正です
デザイナを使用する場合IBM Lotus Domino Enterprise Client Access License（約２万円）が必要でした。
なので、（開発しない人）利用する人分のExpressと、開発する人分のEnterprise Client が必要になります。
全部Enterprise Client にすると、サーバーライセンスが無くなってしまうので注意が必要です。
分からなくなったら、「ダイヤルＩＢＭ」のおねえさんに確認するのが１番。